NPAS2

NPAS2
Ідентифікатори
Символи	NPAS2, MOP4, PASD4, bHLHe9, neuronal PAS domain protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603347 MGI: 109232 HomoloGene: 1887 GeneCards: NPAS2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• Hsp90 protein binding; • protein dimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • transcription regulator complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • ритмічний процес; • GO:1900404 positive regulation of DNA repair; • negative regulation of cell death; • circadian regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • response to redox state; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • central nervous system development; • циркадний ритм; • regulation of response to DNA damage stimulus; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of lipid metabolic process; • positive regulation of behavioral fear response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4862
	18143
	ENSG00000170485
	ENSMUSG00000026077
	Q99743
	P97460
	NM_002518
	NM_008719
	NP_002509
	NP_032745
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NPAS2 (англ. Neuronal PAS domain protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 824 амінокислот, а молекулярна маса — 91 791^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEDEKDRAK	RASRNKSEKK	RRDQFNVLIK	ELSSMLPGNT	RKMDKTTVLE
KVIGFLQKHN	EVSAQTEICD	IQQDWKPSFL	SNEEFTQLML	EALDGFIIAV
TTDGSIIYVS	DSITPLLGHL	PSDVMDQNLL	NFLPEQEHSE	VYKILSSHML
VTDSPSPEYL	KSDSDLEFYC	HLLRGSLNPK	EFPTYEYIKF	VGNFRSYNNV
PSPSCNGFDN	TLSRPCRVPL	GKEVCFIATV	RLATPQFLKE	MCIVDEPLEE
FTSRHSLEWK	FLFLDHRAPP	IIGYLPFEVL	GTSGYDYYHI	DDLELLARCH
QHLMQFGKGK	SCCYRFLTKG	QQWIWLQTHY	YITYHQWNSK	PEFIVCTHSV
VSYADVRVER	RQELALEDPP	SEALHSSALK	DKGSSLEPRQ	HFNTLDVGAS
GLNTSHSPSA	SSRSSHKSSH	TAMSEPTSTP	TKLMAEASTP	ALPRSATLPQ
ELPVPGLSQA	ATMPAPLPSP	SSCDLTQQLL	PQTVLQSTPA	PMAQFSAQFS
MFQTIKDQLE	QRTRILQANI	RWQQEELHKI	QEQLCLVQDS	NVQMFLQQPA
VSLSFSSTQR	PEAQQQLQQR	SAAVTQPQLG	AGPQLPGQIS	SAQVTSQHLL
RESSVISTQG	PKPMRSSQLM	QSSGRSGSSL	VSPFSSATAA	LPPSLNLTTP
ASTSQDASQC	QPSPDFSHDR	QLRLLLSQPI	QPMMPGSCDA	RQPSEVSRTG
RQVKYAQSQT	VFQNPDAHPA	NSSSAPMPVL	LMGQAVLHPS	FPASQPSPLQ
PAQARQQPPQ	HYLQVQAPTS	LHSEQQDSLL	LSTYSQQPGT	LGYPQPPPAQ
PQPLRPPRRV	SSLSESSGLQ	QPPR

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, біологічні ритми, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, ДНК, гемом. Локалізований у ядрі.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Reick M., Garcia J.A., Dudley C., McKnight S.L. (2001). NPAS2: an analog of clock operative in the mammalian forebrain. Science. 293: 506—509. PMID 11441147 DOI:10.1126/science.1060699
Rutter J., Reick M., Wu L.C., McKnight S.L. (2001). Regulation of clock and NPAS2 DNA binding by the redox state of NAD cofactors. Science. 293: 510—514. PMID 11441146 DOI:10.1126/science.1060698
Hoffman A.E., Zheng T., Ba Y., Zhu Y. (2008). The circadian gene NPAS2, a putative tumor suppressor, is involved in DNA damage response. Mol. Cancer Res. 6: 1461—1468. PMID 18819933 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-07-2094
Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 DOI:10.1152/physrev.00016.2012