HMGB4

HMGB4
Ідентифікатори
Символи	HMGB4, dJ1007G16.5, high mobility group box 4
Зовнішні ІД	OMIM: 617285 MGI: 1916567 HomoloGene: 83321 GeneCards: HMGB4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • DNA binding; • transcription factor binding; • DNA binding, bending;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • хромосома; • цитоплазма;
Біологічний процес	• activation of innate immune response; • DNA recombination; • ремоделювання хроматину; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of signaling receptor activity; • positive regulation of autophagy; • GO:0007571 розвойовий процес; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • positive regulation of innate immune response; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cell chemotaxis; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	127540
	69317
	ENSG00000176256
	ENSMUSG00000048686
	Q8WW32
	Q6P8W9
	NM_145205; NM_001352984; NM_001379301
	NM_027036
	NP_660206; NP_001339913; NP_001366230
	NP_081312
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HMGB4 (англ. High mobility group box 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 186 амінокислот, а молекулярна маса — 22 490^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKEIQLKPK	ANVSSYVHFL	LNYRNKFKEQ	QPNTYVGFKE	FSRKCSEKWR
SISKHEKAKY	EALAKLDKAR	YQEEMMNYVG	KRKKRRKRDP	QEPRRPPSSF
LLFCQDHYAQ	LKRENPNWSV	VQVAKATGKM	WSTATDLEKH	PYEQRVALLR
AKYFEELELY	RKQCNARKKY	RMSARNRCRG	KRVRQS

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504