CREB3 Ідентифікатори Символи CREB3 , LUMAN, LZIP, sLZIP, cAMP responsive element binding protein 3 Зовнішні ІД OMIM : 606443 MGI: 99946 HomoloGene: 31375 GeneCards: CREB3 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • protein dimerization activity • cAMP response element binding protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • CCR1 chemokine receptor binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cAMP response element binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • ядерні тільця • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • neuronal cell body • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • гіалоплазма • Golgi membrane • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі
Біологічний процес • negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • release from viral latency • positive regulation of cell migration • cytoplasmic sequestering of transcription factor • negative regulation of cell cycle • positive regulation of monocyte chemotaxis • transcription, DNA-templated • response to endoplasmic reticulum stress • induction of positive chemotaxis • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • хемотаксис • response to unfolded protein • regulation of cell population proliferation • regulation of cell growth • establishment of viral latency • positive regulation of deacetylase activity • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in unfolded protein response • GO:0022415 viral process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of defense response to virus by host • positive regulation of calcium ion transport • transcription by RNA polymerase II • Відповідь на незгорнуті білки • regulation of apoptotic process
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 9: 35.73 – 35.74 Mb Хр. 4: 43.56 – 43.57 Mb PubMed search [1] [2] Вікідані
CREB3 (англ. CAMP responsive element binding protein 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот , а молекулярна маса — 43 917[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MELELDAGDQ DLLAFLLEES GDLGTAPDEA VRAPLDWALP LSEVPSDWEV DDLLCSLLSP PASLNILSSS NPCLVHHDHT YSLPRETVSM DLGECEISLT GRTGFMGLAI HTFPFAESES CRKEGTQMTP QHMEELAEQE IARLVLTDEE KSLLEKEGLI LPETLPLTKT EEQILKRVRR KIRNKRSAQE SRRKKKVYVG GLESRVLKYT AQNMELQNKV QLLEEQNLSL LDQLRKLQAM VIEISNKTSS SSTCILVLLV SFCLLLVPAM YSSDTRGSLP AEHGVLSRQL RALPSEDPYQ LELPALQSEV PKDSTHQWLD GSDCVLQAPG NTSCLLHYMP QAPSAEPPLE WPFPDLFSEP LCRGPILPLQ ANLTRKGGWL PTGSPSVILQ DRYSG
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів . Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус , транскрипція , регуляція транскрипції , відповідь на порушення конформації білку, хемотаксис , альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з ДНК . Локалізований у цитоплазмі , ядрі , мембрані, ендоплазматичному ретикулумі .
Lu R., Yang P., O'Hare P., Misra V. (1997). Luman, a new member of the CREB/ATF family, binds to herpes simplex virus VP16-associated host cellular factor . Mol. Cell. Biol . 17 : 5117—5126. PMID 9271389 DOI :10.1128/MCB.17.9.5117 Freiman R.N., Herr W. (1997). Viral mimicry: common mode of association with HCF by VP16 and the cellular protein LZIP. Genes Dev . 11 : 3122—3127. PMID 9389645 DOI :10.1101/gad.11.23.3122 Kang H., Kim Y.S., Ko J. (2009). A novel isoform of human LZIP negatively regulates the transactivation of the glucocorticoid receptor. Mol. Endocrinol . 23 : 1746—1757. PMID 19779205 DOI :10.1210/me.2009-0009 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504 Lu R., Misra V. (2000). Potential role for luman, the cellular homologue of herpes simplex virus VP16 (alpha gene trans-inducing factor), in herpesvirus latency . J. Virol . 74 : 934—943. PMID 10623756 DOI :10.1128/JVI.74.2.934-943.2000 Mahajan S.S., Wilson A.C. (2000). Mutations in host cell factor 1 separate its role in cell proliferation from recruitment of VP16 and LZIP . Mol. Cell. Biol . 20 : 919—928. PMID 10629049 DOI :10.1128/MCB.20.3.919-928.2000
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер (2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль (3.4) Фактори теплового шоку (3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR (4.2) STAT (4.3) p53 (4.4) MADS (4.6) TATA (4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні (0.6) Інші