SALL2

SALL2
Ідентифікатори
Символи	SALL2, COLB, HSAL2, Sal-2, ZNF795, p150(Sal2), spalt-like transcription factor 2, spalt like transcription factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602219 MGI: 1354373 HomoloGene: 9269 GeneCards: SALL2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• NuRD complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• розвиток ока; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • neural tube development; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6297
	50524
	ENSG00000165821
	ENSMUSG00000049532
	Q9Y467
	Q9QX96
	NM_001291446; NM_001291447; NM_005407; NM_001364564
	NM_001244916; NM_015772
	NP_001278375; NP_001278376; NP_005398; NP_001351493
	NP_001231845; NP_056587
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SALL2 (англ. Spalt like transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 007 амінокислот, а молекулярна маса — 105 309^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRRKQRKPQ	QLISDCEGPS	ASENGDASEE	DHPQVCAKCC	AQFTDPTEFL
AHQNACSTDP	PVMVIIGGQE	NPNNSSASSE	PRPEGHNNPQ	VMDTEHSNPP
DSGSSVPTDP	TWGPERRGEE	SPGHFLVAAT	GTAAGGGGGL	ILASPKLGAT
PLPPESTPAP	PPPPPPPPPP	GVGSGHLNIP	LILEELRVLQ	QRQIHQMQMT
EQICRQVLLL	GSLGQTVGAP	ASPSELPGTG	TASSTKPLLP	LFSPIKPVQT
SKTLASSSSS	SSSSSGAETP	KQAFFHLYHP	LGSQHPFSAG	GVGRSHKPTP
APSPALPGST	DQLIASPHLA	FPSTTGLLAA	QCLGAARGLE	ATASPGLLKP
KNGSGELSYG	EVMGPLEKPG	GRHKCRFCAK	VFGSDSALQI	HLRSHTGERP
YKCNVCGNRF	TTRGNLKVHF	HRHREKYPHV	QMNPHPVPEH	LDYVITSSGL
PYGMSVPPEK	AEEEAATPGG	GVERKPLVAS	TTALSATESL	TLLSTSAGTA
TAPGLPAFNK	FVLMKAVEPK	NKADENTPPG	SEGSAISGVA	ESSTATRMQL
SKLVTSLPSW	ALLTNHFKST	GSFPFPYVLE	PLGASPSETS	KLQQLVEKID
RQGAVAVTSA	ASGAPTTSAP	APSSSASSGP	NQCVICLRVL	SCPRALRLHY
GQHGGERPFK	CKVCGRAFST	RGNLRAHFVG	HKASPAARAQ	NSCPICQKKF
TNAVTLQQHV	RMHLGGQIPN	GGTALPEGGG	AAQENGSEQS	TVSGAGSFPQ
QQSQQPSPEE	ELSEEEEEED	EEEEEDVTDE	DSLAGRGSES	GGEKAISVRG
DSEEASGAEE	EVGTVAAAAT	AGKEMDSNEK	TTQQSSLPPP	PPPDSLDQPQ
PMEQGSSGVL	GGKEEGGKPE	RSSSPASALT	PEGEATSVTL	VEELSLQEAM
RKEPGESSSR	KACEVCGQAF	PSQAALEEHQ	KTHPKEGPLF	TCVFCRQGFL
ERATLKKHML	LAHHQVQPFA	PHGPQNIAAL	SLVPGCSPSI	TSTGLSPFPR
KDDPTIP

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504