SREBF2

SREBF2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1UKL
Ідентифікатори
Символи	SREBF2, SREBP-2, SREBP2, bHLHd2, sterol regulatory element binding transcription factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600481 MGI: 107585 HomoloGene: 20966 GeneCards: SREBF2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• C-8 sterol isomerase activity; • DNA binding; • protein dimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • E-box binding; • protein C-terminus binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • гіалоплазма; • SREBP-SCAP-Insig complex; • комплекс Ґольджі; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • Golgi membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • мітохондрія; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• steroid metabolic process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of protein targeting to mitochondrion; • lipid metabolism; • positive regulation of cholesterol storage; • cellular response to laminar fluid shear stress; • cellular response to starvation; • cholesterol metabolic process; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • regulation of autophagy of mitochondrion; • negative regulation of cholesterol efflux; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of cholesterol biosynthetic process; • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6721
	20788
	ENSG00000198911
	ENSMUSG00000022463
	Q12772
	Q3U1N2
	NM_004599
	NM_033218
	NP_004590
	NP_150087
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SREBF2 (англ. Sterol regulatory element binding transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 141 амінокислот, а молекулярна маса — 123 688^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDDSGELGGL	ETMETLTELG	DELTLGDIDE	MLQFVSNQVG	EFPDLFSEQL
CSSFPGSGGS	GSSSGSSGSS	SSSSNGRGSS	SGAVDPSVQR	SFTQVTLPSF
SPSAASPQAP	TLQVKVSPTS	VPTTPRATPI	LQPRPQPQPQ	PQTQLQQQTV
MITPTFSTTP	QTRIIQQPLI	YQNAATSFQV	LQPQVQSLVT	SSQVQPVTIQ
QQVQTVQAQR	VLTQTANGTL	QTLAPATVQT	VAAPQVQQVP	VLVQPQIIKT
DSLVLTTLKT	DGSPVMAAVQ	NPALTALTTP	IQTAALQVPT	LVGSSGTILT
TMPVMMGQEK	VPIKQVPGGV	KQLEPPKEGE	RRTTHNIIEK	RYRSSINDKI
IELKDLVMGT	DAKMHKSGVL	RKAIDYIKYL	QQVNHKLRQE	NMVLKLANQK
NKLLKGIDLG	SLVDNEVDLK	IEDFNQNVLL	MSPPASDSGS	QAGFSPYSID
SEPGSPLLDD	AKVKDEPDSP	PVALGMVDRS	RILLCVLTFL	CLSFNPLTSL
LQWGGAHDSD	QHPHSGSGRS	VLSFESGSGG	WFDWMMPTLL	LWLVNGVIVL
SVFVKLLVHG	EPVIRPHSRS	SVTFWRHRKQ	ADLDLARGDF	AAAAGNLQTC
LAVLGRALPT	SRLDLACSLS	WNVIRYSLQK	LRLVRWLLKK	VFQCRRATPA
TEAGFEDEAK	TSARDAALAY	HRLHQLHITG	KLPAGSACSD	VHMALCAVNL
AECAEEKIPP	STLVEIHLTA	AMGLKTRCGG	KLGFLASYFL	SRAQSLCGPE
HSAVPDSLRW	LCHPLGQKFF	MERSWSVKSA	AKESLYCAQR	NPADPIAQVH
QAFCKNLLER	AIESLVKPQA	KKKAGDQEEE	SCEFSSALEY	LKLLHSFVDS
VGVMSPPLSR	SSVLKSALGP	DIICRWWTSA	ITVAISWLQG	DDAAVRSHFT
KVERIPKALE	VTESPLVKAI	FHACRAMHAS	LPGKADGQQS	SFCHCERASG
HLWSSLNVSG	ATSDPALNHV	VQLLTCDLLL	SLRTALWQKQ	ASASQAVGET
YHASGAELAG	FQRDLGSLRR	LAHSFRPAYR	KVFLHEATVR	LMAGASPTRT
HQLLEHSLRR	RTTQSTKHGE	VDAWPGQRER	ATAILLACRH	LPLSFLSSPG
QRAVLLAEAA	RTLEKVGDRR	SCNDCQQMIV	KLGGGTAIAA	S

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hua X., Sakai J., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Regulated cleavage of sterol regulatory element binding proteins requires sequences on both sides of the endoplasmic reticulum membrane. J. Biol. Chem. 271: 10379—10384. PMID 8626610 DOI:10.1074/jbc.271.17.10379
Pai J.-T., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Purification and cDNA cloning of a second apoptosis-related cysteine protease that cleaves and activates sterol regulatory element binding proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 5437—5442. PMID 8643593 DOI:10.1073/pnas.93.11.5437
Duncan E.A., Dave U.P., Sakai J., Goldstein J.L., Brown M.S. (1998). Second-site cleavage in sterol regulatory element-binding protein occurs at transmembrane junction as determined by cysteine panning. J. Biol. Chem. 273: 17801—17809. PMID 9651382 DOI:10.1074/jbc.273.28.17801
Ye J., Dave U.P., Grishin N.V., Goldstein J.L., Brown M.S. (2000). Asparagine-proline sequence within membrane-spanning segment of SREBP triggers intramembrane cleavage by site-2 protease. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 5123—5128. PMID 10805775 DOI:10.1073/pnas.97.10.5123
Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009). The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage. J. Biol. Chem. 284: 28995—29004. PMID 19706601 DOI:10.1074/jbc.M109.041376