HOXA9

HOXA9
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1PUF
Ідентифікатори
Символи	HOXA9, ABD-B, HOX1, HOX1.7, HOX1G, homeobox A9
Зовнішні ІД	OMIM: 142956 MGI: 96180 HomoloGene: 7766 GeneCards: HOXA9
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • enzyme binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • transcription regulator complex; • цитоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • endothelial cell activation; • transcription, DNA-templated; • multicellular organism development; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of myeloid cell differentiation; • Сперматогенез; • single fertilization; • male gonad development; • anterior/posterior pattern specification; • proximal/distal pattern formation; • регуляція експресії генів; • mammary gland development; • embryonic forelimb morphogenesis; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • embryonic skeletal system development; • uterus development; • definitive hemopoiesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3205
	15405
	ENSG00000078399
	ENSMUSG00000038227
	P31269
	P09631
	NM_152739; NM_002142
	NM_001277238; NM_010456
	NP_689952
	NP_001264167; NP_034586
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXA9 (англ. Homeobox A9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 272 амінокислот, а молекулярна маса — 30 172^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATTGALGNY	YVDSFLLGAD	AADELSVGRY	APGTLGQPPR	QAATLAEHPD
FSPCSFQSKA	TVFGASWNPV	HAAGANAVPA	AVYHHHHHHP	YVHPQAPVAA
AAPDGRYMRS	WLEPTPGALS	FAGLPSSRPY	GIKPEPLSAR	RGDCPTLDTH
TLSLTDYACG	SPPVDREKQP	SEGAFSENNA	ENESGGDKPP	IDPNNPAANW
LHARSTRKKR	CPYTKHQTLE	LEKEFLFNMY	LTRDRRYEVA	RLLNLTERQV
KIWFQNRRMK	MKKINKDRAK	DE

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література[ред. | ред. код]

Patel C.V., Sharangpani R., Bandyopadhyay S., DiCorleto P.E. (1999). Endothelial cells express a novel, tumor necrosis factor-alpha-regulated variant of HOXA9. J. Biol. Chem. 274: 1415—1422. PMID 9880515 DOI:10.1074/jbc.274.3.1415
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504