HOXC9

HOXC9
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2LP0, 2MSY
Ідентифікатори
Символи	HOXC9, HOX3, HOX3B, homeobox C9
Зовнішні ІД	OMIM: 142971 MGI: 96199 HomoloGene: 130558 GeneCards: HOXC9
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • aggresome;
Біологічний процес	• embryonic skeletal system morphogenesis; • multicellular organism development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • anterior/posterior pattern specification; • embryonic skeletal system development; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3225
	15427
	ENSG00000180806
	ENSMUSG00000036139
	P31274
	P09633
	NM_006897
	NM_008272
	NP_008828
	NP_032298
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXC9 (англ. Homeobox C9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 260 амінокислот, а молекулярна маса — 29 248^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSATGPISNY	YVDSLISHDN	EDLLASRFPA	TGAHPAAARP	SGLVPDCSDF
PSCSFAPKPA	VFSTSWAPVP	SQSSVVYHPY	GPQPHLGADT	RYMRTWLEPL
SGAVSFPSFP	AGGRHYALKP	DAYPGRRADC	GPGEGRSYPD	YMYGSPGELR
DRAPQTLPSP	EADALAGSKH	KEEKADLDPS	NPVANWIHAR	STRKKRCPYT
KYQTLELEKE	FLFNMYLTRD	RRYEVARVLN	LTERQVKIWF	QNRRMKMKKM
NKEKTDKEQS

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhou B., Liu C., Xu Z., Zhu G. (2012). Structural basis for homeodomain recognition by the cell-cycle regulator Geminin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109: 8931—8936. PMID 22615398 DOI:10.1073/pnas.1200874109