해양수산부 차관(海洋水産部 次官)은 해양수산부 장관을 보좌하는 직위다. 정무직공무원으로 보한다.
- 해양수산부 차관은 장관을 보좌하여 소관사무를 처리하고 소속공무원을 지휘·감독하며, 장관이 사고로 직무를 수행할 수 없으면 그 직무를 대행한다.
| 정부 | 대수 | 이름 | 임기 | 비고 |
| 제3공화국 | 초대 | 김명년(金命年) | 1966년 2월 28일~1966년 7월 12일 | |
| 2대 | 김재식(金在植) | 1966년 7월 15일~1968년 1월 10일 | |
| 3대 | 장희운(張希雲) | 1968년 2월 1일~1971년 9월 6일 | |
| 4대 | 강용순(姜勇淳) | 1971년 9월 6일~1975년 3월 4일 | |
| 제4공화국 |
| 5대 | 오준석(吳俊碩) | 1975년 3월 10일~1975년 5월 17일 | |
| 6대 | 김인수(金寅洙) | 1975년 5월 20일~1976년 10월 6일 | |
| 7대 | 주홍장(周鴻章) | 1976년 10월 6일~1980년 6월 25일 | |
| 8대 | 최익성(崔益星) | 1980년 6월 25일~1983년 8월 22일 | |
| 제5공화국 |
| 9대 | 이종휘(李鍾輝) | 1983년 8월 22일~1988년 4월 4일 | |
| 노태우 정부 | 10대 | 이희수(李羲秀) | 1988년 4월 4일~1991년 7월 9일 | |
| 11대 | 김시문(金是文) | 1991년 7월 9일~1992년 10월 20일 | |
| 12대 | 하성환(河星煥) | 1992년 10월 20일~1993년 5월 1일 | |
| 김영삼 정부 | 13대 | 박광훈(朴光勳) | 1993년 5월 1일~1994년 12월 26일 | |
| 14대 | 안성봉(安性奉) | 1995년 1월 10일~1996년 2월 1일 | |
| 15대 | 임종국(林鍾國) | 1996년 2월 1일~1996년 8월 7일 | |
| 정부 | 대수 | 이름 | 임기 | 비고 |
| 제4공화국 | 초대 | 문명린(文明麟) | 1977년 12월 16일~1980년 7월 31일 | |
| 2대 | 정연세(鄭然世) | 1980년 7월 31일~1984년 2월 3일 | |
| 제5공화국 |
| 3대 | 한태열(韓泰烈) | 1984년 2월 3일~1987년 7월 3일 | |
| 4대 | 황규진(黃圭鎭) | 1987년 7월 3일~1990년 3월 | |
| 노태우 정부 |
| 5대 | 염태섭(廉台燮) | 1990년 3월~1992년 5월 1일 | |
| 6대 | 김광득(金光得) | 1992년 5월 1일~1996년 1월 24일 | |
| 김영삼 정부 |
| 7대 | 이항규(李恒圭) | 1996년 1월 24일~1996년 8월 7일 | |
| 정부 | 대수 | 이름 | 임기 | 비고 |
| 김영삼 정부 | 초대 | 임창열(林昌烈) | 1996년 8월 13일~1996년 12월 23일 | |
| 2대 | 장승우(張承玗) | 1996년 12월 24일~1998년 3월 8일 | |
| 김대중 정부 | 3대 | 전승규(全昇圭) | 1998년 3월 9일~1999년 5월 2일 | |
| 4대 | 홍승용(洪承湧) | 1999년 5월 3일~2002년 2월 4일 | |
| - | 신길웅(申吉雄) | 1999년 12월 19일 | 추서 |
| 5대 | 유정석(柳正錫) | 2002년 2월 5일~2003년 3월 2일 | |
| 노무현 정부 | 6대 | 최낙정(崔洛正) | 2003년 3월 3일~2003년 9월 18일 | |
| 7대 | 김영남(金英南) | 2003년 9월 19일~2004년 10월 17일 | |
| 8대 | 강무현(姜武賢) | 2004년 10월 18일~2006년 8월 8일 | |
| 9대 | 이은(李垠) | 2006년 8월 9일~2008년 2월 29일 | |
| 정부 | 대수 | 이름 | 임기 | 비고 |
| 이명박 정부 | 초대 | 정학수(丁鶴秀) | 2008년 3월 1일~2009년 1월 22일 | |
| 2대 | 민승규(閔勝奎) | 2009년 1월 23일~2010년 8월 16일 | |
| 3대 | 김재수(金在水) | 2010년 8월 16일~2011년 7월 22일 | |
| 4대 | 이상길(李相吉) | 2011년 7월 22일~2013년 3월 13일 | |
| 정부 | 대수 | 이름 | 임기 | 비고 |
| 이명박 정부 | 초대 | 박덕배(朴德培) | 2008년 3월 1일~2009년 1월 22일 | |
| 2대 | 하영제(河榮帝) | 2009년 1월 23일~2010년 8월 16일 | |
| 3대 | 정승(鄭勝) | 2010년 8월 16일~2011년 6월 7일 | |
| 4대 | 오정규(吳定圭) | 2011년 6월 7일~2013년 3월 13일 | |
| 정부 | 대수 | 이름 | 임기 | 비고 |
| 이명박 정부 | 초대 | 권도엽(權度燁) | 2008년 3월 3일~2010년 8월 16일 | |
| 2대 | 정창수(鄭昌洙) | 2010년 8월 16일~2011년 5월 17일 | |
| 3대 | 한만희(韓晩喜) | 2011년 5월 18일~2013년 3월 13일 | |
| 정부 | 대수 | 이름 | 임기 | 비고 |
| 이명박 정부 | 초대 | 이재균(李在均) | 2008년 3월 3일~2009년 1월 20일 | |
| 2대 | 최장현(崔壯賢) | 2009년 1월 20일~2010년 8월 16일 | |
| 3대 | 김희국(金熙國) | 2010년 8월 16일~2012년 1월 8일 | |
| 4대 | 주성호(朱成晧) | 2012년 1월 8일~2013년 3월 13일 | |
| 정부 | 대수 | 이름 | 임기 | 비고 |
| 박근혜 정부 | 10대 | 손재학(孫在學) | 2013년 3월 25일~2014년 8월 3일 | |
| 11대 | 김영석(金榮錫) | 2014년 8월 4일~2015년 10월 20일 | |
| 12대 | 윤학배(尹學培) | 2015년 10월 21일~2017년 6월 14일 | |
| 문재인 정부 | 13대 | 강준석(姜俊錫) | 2017년 6월 15일~2018년 8월 26일 | |
| 14대 | 김양수(金良洙) | 2018년 8월 27일~2020년 8월 14일 | |
| 15대 | 박준영(朴俊泳) | 2020년 8월 15일~2021년 5월 20일 | |
| 16대 | 엄기두(嚴基斗) | 2021년 5월 21일~2022년 5월 9일 | |
| 윤석열 정부 | 17대 | 송상근(宋相根) | 2022년 5월 10일~2023년 7월 2일 |
| 18대 | 박성훈(朴成訓) | 2023년 7월 3일~2023년 12월 27일 |
| 19대 | 송명달(宋明達) | 2023년 12월 28일~ |
