本列表整理醫療法人（醫療財團法人、醫療社團法人）、私立醫學院校、宗教財團法人、公益法人、營利社團法人（即公司）等各類型私法人所設立的醫院
按中華民國《醫療法》的定義：
醫療機構設有病房收治病人者為醫院，僅應門診者為診所。
醫療財團法人係指以從事醫療事業辦理醫療機構為目的，由捐助人捐助一定財產，經中央主管機關（目前是司法院各地方法院）許可並向法院登記之財團法人。
醫療社團法人係指以從事醫療事業辦理醫療機構為目的，經中央主管機關（目前是衛生福利部）許可登記之社團法人。
本表所載之財團法人名稱，皆以刊登於衛生福利部醫院資訊公開平台[1]、司法院法人登記及夫妻財產登記查詢系統[2]者為準。
| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 國泰綜合醫院 | 臺北市大安區仁愛路四段280號 | www.cgh.org.tw | - 醫院評鑑優等（醫學中心）（2013/01-2016/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（醫學中心）（2013/01-2016/12）
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| 汐止國泰綜合醫院 | 新北市汐止區建成路59巷2號 | sijhih.cgh.org.tw | - 醫院評鑑優等（區域醫院）（2014/01-2017/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2013/01-2016/12）
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| 新竹國泰綜合醫院 | 新竹市東區中華路二段678號 | hsinchu.cgh.org.tw | - 醫院評鑑優等（地區醫院）（2014/01-2017/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2013/01-2016/12）
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| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 奇美醫院 | - 總院：臺南市永康區中華路901號
- 樹林院區：臺南市南區樹林街二段442號
| | - 醫院評鑑優等（醫學中心）（2012/01-2015/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（醫學中心）（2012/01-2015/12）
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| 柳營奇美醫院 | | | - 醫院評鑑優等（區域醫院）（2013/01-2016/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2013/01-2016/12）
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| 佳里奇美醫院 | | | - 醫院評鑑優等（地區醫院）（2013/01-2016/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2013/01-2016/12）
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| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 台中仁愛醫院 | | | - 新制醫院評鑑優等（2011/01-2014/12）
| 與長庚醫療財團法人建立合作聯盟 |
| 大里仁愛醫院 | | | - 醫院評鑑優等（區域醫院）（2012/01-2015/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2014/01-2017/12）
| 與長庚醫療財團法人建立合作聯盟 |
| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 花蓮慈濟醫院 | | | - 醫院評鑑優等（醫學中心）（2014/01-2017/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（醫學中心）（2014/01-2017/12）
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| 玉里慈濟醫院 | | | - 醫院評鑑合格（地區醫院）（2014/01-2017/12）
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| 關山慈濟醫院 | | | - 醫院評鑑合格（地區醫院）（2012/01-2015/12）
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| 大林慈濟醫院 | | | - 醫院評鑑優等（準醫學中心）（2012/01-2015/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2012/01-2015/12）
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| 台中慈濟醫院 | | | - 新制醫院評鑑特優（2011/01-2014/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2014/01-2017/12）
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| 台北慈濟醫院 | | | - 醫院評鑑優等（醫學中心）（2024/10-）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2013/01-2016/12）
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| 斗六慈濟醫院 | | | | |
| 三義慈濟中醫醫院 | | | | |
天主教會台北教省所轄的教區，及經羅馬天主教廷認可的修道士團體在臺灣本島及澎湖列島設立了多個醫療財團法人。
- 財團法人台灣省嘉義市天主教會嘉義教區中華聖母會：天主教中華聖母修女會醫療財團法人
- 財團法人天主教聖母無原罪方濟傳教修女會：財團法人天主教聖功醫院
- 財團法人沙爾德聖保祿修女會：沙爾德聖保祿修女會醫療財團法人
| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 耕莘醫院 | | | - 新制醫院評鑑特優（2011/01-2014/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2014/01-2017/12）
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| 永和耕莘醫院 | | | - 新制醫院評鑑優等（2011/01-2014/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2014/01-2017/12）
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| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 天主教仁慈醫療財團法人仁慈醫院 | | | - 新制醫院評鑑優等（2011/01-2014/12）
- 醫事人員類（非醫師）教學醫院評鑑合格（2014/01-2017/12）
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| 天主教若瑟醫療財團法人若瑟醫院 | | | - 醫院評鑑優等（區域醫院）（2012/01-2015/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2012/01-2015/12）
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| 天主教花蓮教區醫療財團法人台東聖母醫院 | | | - 醫院評鑑合格（地區醫院）（2013/01-2016/12）
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| 天主教中華聖母修女會醫療財團法人天主教聖馬爾定醫院 | | | - 新制醫院評鑑特優（2011/01-2014/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2013/01-2016/12）
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| 財團法人天主教聖功醫院 | | | - 醫院評鑑優等（地區醫院）（2013/01-2016/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2014/01-2017/12）
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| 沙爾德聖保祿修女會醫療財團法人聖保祿醫院 | | | - 醫院評鑑優等（區域醫院）（2013/01-2016/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2012/01-2015/12）
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財團法人台灣基督長老教會捐助成立台灣基督長老教會新樓醫療財團法人（下稱新樓醫療財團法人）、彰化基督教醫療財團法人和財團法人臺灣基督長老教會馬偕紀念社會事業基金會（下稱財團法人馬偕紀念社會事業基金會）等公益法人。台灣基督長老教會屬基督（新）教長老宗。
| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 台南新樓醫院 | | | - 醫院評鑑優等（區域醫院）（2014/01-2017/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2013/01-2016/12）
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| 麻豆新樓醫院 | | | - 醫院評鑑優等（區域醫院）（2014/01-2017/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2013/01-2016/12）
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由財團法人北部台灣基督長老教會掌理 總稱馬偕醫療體系
| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 馬偕紀念醫院 | - 總院臺北院區（總院本部）：臺北市中山區中山北路二段92號
- 新竹分院：新竹市東區光復路二段690號
- 台東分院；臺東縣臺東市長沙街303巷1號
| | - 總院
- 醫院評鑑優等（醫學中心）（2013/01-2016/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（醫學中心）（2013/01-2016/12）
- 新竹分院
- 新制醫院評鑑特優（2011/01-2014/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2013/01-2016/12）
- 台東分院
- 醫院評鑑優等（區域醫院）（2012/01-2015/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2012/01-2015/12）
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| 馬偕兒童醫院 | | 馬偕兒童醫院（页面存档备份，存于互联网档案馆） | | |
基督（新）教各宗派的教會（Church）、宗派性的或跨宗派性的傳教會（Mission）於臺灣本島設立多個醫療財團法人醫院。
- 財團法人台灣基督教門諾會：臺灣基督教門諾會醫療財團法人
- 財團法人基督復臨安息日會台灣區會：基督復臨安息日會醫療財團法人
- 財團法人台灣基督教協同會：東基醫療財團法人
- 財團法人基督教台灣信義會：戴德森醫療財團法人、信義醫療財團法人
- 挪威協力差會（Norwegian Mission Alliance）：屏基醫療財團法人；埔基醫療財團法人（與財團法人台灣世界展望會一同捐助成立）
- 基督教信義會芬蘭差會（Finnish Evangelical Lutheran Mission）：恆基醫療財團法人
| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 李綜合醫療社團法人苑裡李綜合醫院 | | | - 醫院評鑑優等（地區醫院）（2014/01-2017/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2013/01-2016/12）
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| 李綜合醫療社團法人大甲李綜合醫院 | | | - 醫院評鑑優等（區域醫院）（2012/01-2015/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2014/01-2017/12）
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| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 中英醫院 | | | - 醫院評鑑合格（地區醫院）（2013/01-2016/12）
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| 板英醫院 | | | - 醫院評鑑合格（地區醫院）（2012/01-2015/12）
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| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 安泰醫院 | | | - 醫院評鑑優等（區域醫院）（2012/01-2015/12）
- 新制教學醫院評鑑優等（2011/01-2014/12）
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| 潮州安泰醫院 | | | - 新制醫院評鑑優等（2011/01-2014/12）
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以下宗教財團法人設有附設醫院
財團法人天主教靈醫會為天主教修道會
| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 惠民醫院 | | | - 醫院評鑑合格（地區醫院）（2014/01-2017/12）
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| 羅東聖母醫院 | | | - 醫院評鑑優等（區域醫院）（2014/01-2017/12）
- 醫師及醫事人員類教學醫院評鑑合格（2013/01-2016/12）
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財團法人天主教中華道明修女會為天主教修道會
| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 天主教福安醫院 | | | - 醫院評鑑合格（地區醫院）（2013/01-2016/12）
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| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 新竹新生醫院 | | | - 醫院評鑑合格（地區醫院）（2014/01-2017/12）
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| 苗栗新生醫院 | | | - 醫院評鑑合格（地區醫院）（2014/01-2017/12）
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| 院名 | 地址 | 網址 | 最近一次評鑑成績（效期） | 備註 |
| 中華郵政股份有限公司郵政醫院 | | 郵政醫院 （页面存档备份，存于互联网档案馆） | - 醫院評鑑合格（地區醫院）（2020/01-2026/12）
| - 中華郵政股份有限公司為中華民國（交通部）100％持股的公股公司（國營事業）
- 目前委託中英醫療社團法人經營中
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