Народився 21 січня1984 року в місті Белград в родині футболіста «Црвени Звезди»Джордже Миловановича. Молодий Деян також вирішив стати футболістом і став вихованцем футбольної школи клубу «Црвена Звезда». Деян став першим гравцем з талановитого покоління 1984 року, який почав виступати за основну команду свого рідного клубу. Це сталося 17 листопада2001 ріоку, коли Деяну було всього 17 років. По-справжньому він звернув на себе увагу з боку громадськості під час дербі проти «Партизана», де пройшов трьох гравців і забив м'яч. Та зустріч закінчилася з рахунком 3:0.
2004 року Деян недовго виступав за друголігове «Єдинство» (Уб), після чого повернувся в «Црвена Звезду» і у 2006 році отримав капітанську пов'язку. Всього за рідний клуб Милованович провів 209 зустрічей. Разом із «Црвеною Звездою» він зробив три «золотих дублі» на внутрішній арені.
Своєю грою за останню команду привернув увагу представників тренерського штабу клубу «Ланс», до складу якого приєднався 2008 року. У першому сезоні Деян відіграв за команду з Ланса 24 матчі (2 голи) в Лізі 2 і допоміг команді зайняти перше місце та вийти в Лігу 1. Проте після цього втратив місце в основі і лише зрідка виходив на поле, зігравши за сезон лише у 16 матчах чемпіонату. Через це по завершенні сезону сербського легіонера віддавали в оренду в рідну «Црвену Звезду» та грецький «Паніоніос».
Завершив професійну ігрову кар'єру у клубі «Вождовац», за команду якого виступав протягом сезону 2013/14 років[1].
↑[1] [Архівовано 16 вересня 2015 у Wayback Machine.] Blic Sport: Liveblog: Transferi: Milan zove Kačara, Milovanović u Voždovcu, Kasiljas razmišlja i o Arsenalu (серб.) 21 August 2013