Den 31 januari 2019 lånades Hinteregger ut till Eintracht Frankfurt på ett låneavtal över resten av säsongen 2018/2019.[1] Inför säsongen 2019/2020 värvades han av Eintracht Frankfurt på en permanent övergång.[2]
Den 23 juni 2022 kom Hinteregger och Eintracht Frankfurt överens om att bryta kontraktet, då Hinteregger önskade avsluta sin aktiva fotbollskarriär.[3]