Orthocoronavirinae

Из Википедии, бесплатной энциклопедии

Orthocoronavirinae
SARS CoV.jpg
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus (SARSCoV)
Научная классификация
Международное научное название

Orthocoronavirinae

Синонимы
  • Coronavirinae
Группа по Балтимору

IV: (+)оцРНК-вирусы

Orthocoronavirinae (лат.) — подсемейство вирусов из семейства коронавирусов[2], объединяющее оболочечные РНК-содержащие плеоморфные[К 1] вирусы, вызывающие широкий спектр заболеваний различной тяжести у животных, включая человека[3]. В большинстве случаев коронавирусные инфекции протекают в лёгкой форме, однако в XXI веке происходили вспышки тяжёлых заболеваний, вызываемых бетакоронавирусами MERS-CoV и SARS-CoV[3], а также SARS-CoV-2. Это вирусы с (+)одноцепочечной РНК-геном и нуклеокапсидом спиральной симметрии. Размер генома коронавирусов варьируется от приблизительно 27 до 34 килобаз, самый большой среди известных РНК-вирусов.

Геном[править | править код]

Схематическое изображение организации генома и функциональных доменов S-белков вирусов SARS-CoV и MERS-CoV

Коронавирусы содержат геном с одноцепочечной смысловой РНК. Размер их генома колеблется от 27 до 34 килобаз является одним из самых больших среди РНК-вирусов. Геном имеет 5'-метилированный кэп и 3'-полиаденилированный хвост. Геномная организация коронавируса: 5'-НТО лидерная последовательность — репликаза / транскриптаза — шип (S) — оболочка (E) — нуклеокапсид (N) — 3'НТО — поли(A) хвост. Открытые рамки считывания 1a и 1b, которые занимают первые две трети генома, кодируют полипротеин репликазы / транскриптазы. Полипротеины репликазы / транскриптазы саморасщепляется, образуя неструктурные белки (nsps). Далее идут рамки считывания, кодирующие четыре основных структурных белка: шип, оболочку, мембрану и нуклеокапсид. Перемежаясь с этими рамками расположены рамки считывания для вспомогательных белков. Количество вспомогательных белков и их функция различны для разных коронавирусов.

Жизненный цикл[править | править код]

Зарождение[править | править код]

Инфекция начинается, когда вирусный шип (S) гликопротеин прикрепляется к своему комплементарному рецептору клетки-хозяина. После прикрепления протеаза клетки-хозяина расщепляется и активирует прикрепленный к рецептору спайковый белок. В зависимости от доступной протеазы клетки-хозяина, расщепление и активация позволяют клетке проникать посредством эндоцитоза или прямого слияния вирусной оболочки с мембраной хозяина. При проникновении в клетку-хозяина вирусная частица не имеет покрытия и ее геном попадает в цитоплазму клетки. Геном РНК коронавируса имеет 5'-метилированную кепку и 3'-полиаденилированный хвост, что позволяет РНК прикрепляться к рибосоме клетки-хозяина для трансляции. Рибосома хозяина транслирует исходную перекрывающуюся открытую рамку считывания генома вируса и образует длинный полипротеин. Полипротеин имеет свои собственные протеазы, которые расщепляют полипротеин на множество неструктурных белков.

Классификация[править | править код]

До 2009 года представителей подсемейства объединяли в род Coronavirus[4], но в 2009 году систематику коронавирусов пересмотрели: Coronavirus разделили на 3 рода (Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus), объединённых в подсемейство Coronavirinae[5].

Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) по состоянию на апрель 2020 года выделяет в подсемействе 4 рода[6]:

Примечания[править | править код]

Комментарии
  1. Плеоморфные вирусы — вирусы, варьирующие по форме и размерам.
Источники
  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. Щелканов М. Ю., Попова А. Ю., Дедков В. Г., Акимкин В. Г., Малеев В. В. История изучения и современная классификация коронавирусов (Nidovirales: Coronaviridae) (рус.) // Инфекция и иммунитет : научная статья. — 2020. — Т. 10, № 2. — С. 221—246.
  3. 1 2 Zumla A., Chan J. F. W., Azhar E. I., Hui D. S. C., Yuen K.-Y. Coronaviruses — drug discovery and therapeutic options (англ.) // Nature Reviews Drug Discovery. — 2016. — Vol. 15. — P. 327—347. — doi:10.1038/nrd.2015.37.
  4. ICTV Taxonomy History for Coronavirus на сайте ICTV (англ.) (Проверено 19 июля 2019).
  5. Revision of the family Coronaviridae : [англ.] // ICTV. — Code(s) assigned: 2008.085-126V. — 2008. — P. 3—6. — 37 p.
  6. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV)(Проверено 25 мая 2020).

Ссылки[править | править код]