Гаплогруппа DE

Из Википедии, бесплатной энциклопедии

Гаплогруппа DE
{{{размер}}}px
Тип Y-ДНК
Время появления 57000—66000 лет до н. э.[1] / 70000—75000 лет — время разделения CF и DE, и 50000—55000 — время разделения на D и E[2]
Место появления Африка[3] или Азия[4]
Предковая группа CT
Сестринские группы CF
Субклады DE*, D и E
Мутации-маркеры YAP, M145 = P205, M203, P144, P153, P165, P167, P183

Гаплогруппа DE — человеческая Y-хромосомная гаплогруппа. Её определяют мутации однонуклеотидного полиморфизма M1(YAP), M145(P205), M203, P144, P153, P165, P167, P183[5].

Она известна за счёт определяющего её полиморфизма уникального события — инсерции YAP. Эта мутация произошла, когда участок ДНК Alu, копирующий себя, добавил копию в Y-хромосому. Так, Y-хромосомы, содержащие мутацию YAP, называют YAP+, а не содержащие — YAP-.

Появление[править | править код]

Происходит от мутации гаплогруппы CT, произошедшей у мужчины, жившего около 68,5 тыс. лет назад (дата определена по снипам компанией YFull[6]).

По одной версии, гаплогруппа DE и YAP+ появились в Африке[7]. Это подтверждается тем, что:

  1. В Африке YAP имеет наибольшее распространение (более 80 %).
  2. DE содержит две подгруппы, которые не пересекаются филогенетически или географически.
  3. Гаплогруппа C появилась примерно в одно время с DE где-то в Азии, и нет никаких свидетельств, в том числе археологических, о миграциях народов из Азии в Африку в ту эпоху.

Более вероятно, что YAP+ родом из Азии. Это подтверждают следующие аргументы:

  1. Учитывая наличие YAP у носителей гаплогруппы D в северо-восточной Индии и на Андаманских островах, можно предположить, что в Южной Азии некоторые из хромосом M168 привели к добавлению YAP и мутации M174[4].
  2. Гаплогруппа CT, от которой происходит DE, имеет неафриканское происхождение[8].
  3. Существуют свидетельства несколько более поздних перемещений хромосом из Азии в Африку. Большинство африканских линий E имеет явное европеоидное ближневосточное или североафриканское происхождение и их распространение в Африке среди негроидов объясняется эффектом основателя и замещением исконно негроидных линий A и B.

Однако не исключено формирование гаплогруппы в Северной или Восточной Африке.

В 2016 году Позник и Андерхилл показали, что Y-хромосомная гаплогруппа E возникла за пределами Африки, а общий предок всех неафриканских линий (TMRCA), в том числе гаплогрупп DE и CF, жил ~ 76 тыс. лет назад[9]. Разделение гаплогруппы DE на субклады D и E произошло 69,0 ± 14,7 тыс. л. н., приход носителей гаплогруппы Е в Африку произошёл 65,5 ± 8,5 тыс. лет назад[10].

Крис Тайлер-Смит с коллегами считают, что линии DE и CF разошлись 77 тыс. л. н. (исходя из скорости мутации 0,76×10-9 на пару нуклеотидов в год)[11].

Этногеографическое распространение[править | править код]

До сих пор не было найдено ни одного живущего в настоящий момент представителя парагруппы DE. Найденные 5 образцов у нигерийцев оказались на самом деле редким субкладом гаплогруппы D2 (A5580.2)[12]. То же самое относится к образцу из народа налу из Гвинеи-Бисау[13]. У двух представителей на Тибете[14], оказался на самом деле субклад D-M174, а также у одного образца из Республики Алтай в Бешпельтире[15].

Дерево[править | править код]

Филогенетическое дерево YCC 2008[16].

  • DE (YAP, M145 [P205], M203, P144, P153, P165, P167, P183)
    • DE*
    • D (M174, (021355))
    • E (SRY4064, M96, P29, P150, P152, P154, P155, P156, P162)

Примечания[править | править код]

  1. ↑ Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree Архивная копия от 7 июня 2008 на Wayback Machine, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  2. ↑ Upper Palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans, Nature 505, 87–91 (02 January 2014)
  3. ↑ Underhill. The case for an African rather than an Asian origin of the human Y-chromosome YAP insertion // Genetic, Linguistic and Archaeological Perspectives on Human Diversity in Southeast Asia (англ.). — 2001. — ISBN 9810247842.
  4. ↑ 1 2 Chandrasekar et al. (2007), YAP insertion signature in South Asia Архивная копия от 7 ноября 2017 на Wayback Machine, 1: Ann Hum Biol. 2007 Sep-Oct;34(5):582-6.
  5. ↑ ISOGG reference webpage. Дата обращения: 7 июля 2009. Архивировано 20 мая 2011 года.
  6. ↑ DE YTree. Дата обращения: 23 июля 2016. Архивировано 18 августа 2016 года.
  7. ↑ Stone, Linda. Voyages, Prehistoric Human Expansions // Genes, Culture, and Human Evolution (неопр.). — 2007.
  8. ↑ Chuan-Chao Wang, Li Hui. Comparison of Y-chromosomal lineage dating using either evolutionary or genealogical Y-STR mutation rates, bioRxiv posted online May 3, 2014
  9. ↑ Posnik G. D. et al. (2016) Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences Архивная копия от 28 мая 2017 на Wayback Machine, Nature Genetics, 48, 593–599.
  10. ↑ Vicente M Cabrera et al. Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup L3 basic lineages migrated back to Africa from Asia around 70,000 years ago Архивная копия от 14 января 2018 на Wayback Machine, December 13, 2017
  11. ↑ Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; Asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans out of Africa (англ.) // Genetics : journal. — 2019. — 13 June. — P. genetics.302368.2019. — ISSN 0016-6731. — doi:10.1534/genetics.119.302368. — PMID 31196864.
  12. ↑ Weale et al. (2003), Rare Deep-Rooting Y Chromosome Lineages in Humans: Lessons for Phylogeography Архивная копия от 5 мая 2009 на Wayback Machine, Genetics, Vol. 165, 229—234
  13. ↑ Rosa; et al. (2007), "Y-chromosomal diversity in the population of Guinea-Bissau: a multiethnic perspective" (PDF), BMC Evolutionary Biology, 7: 124, doi:10.1186/1471-2148-7-124, Архивировано (PDF) из оригинала 30 мая 2009, Дата обращения: 7 июля 2009 {{citation}}: Явное указание et al. в: |author= (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка) Источник. Дата обращения: 7 июля 2009. Архивировано 30 мая 2009 года.
  14. ↑ Shi et al. (2008) Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations Архивная копия от 31 марта 2010 на Wayback Machine, BMC Biology
  15. ↑ Kharkov et al. (2007)
  16. ↑ Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree Архивная копия от 7 июня 2008 на Wayback Machine, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
Эволюционное древо гаплогрупп Y-хромосомы человека
Y-хромосомный Адам
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1  F2  F3    GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
I J LT (K1) K2
L (K1a)   T (K1b)       K2a/K2a1/NO/NO1 K2b
N O   K2b1     P (K2b2)/P1  
  S (K2b1a) M (K2b1b) Q R  
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Гаплогруппа_DE&oldid=136959516