Het wereldkampioenschap superbike seizoen 2006 was het 19e in de geschiedenis van het door de FIM georganiseerde wereldkampioenschap superbike.
Het seizoen telde twaalf raceweekenden en begon op 25 februari op het Losail International Circuit in Qatar en eindigde op 8 oktober op het Circuit Magny-Cours in Frankrijk. Troy Bayliss, die in 2001 superbike-kampioen werd, keerde terug in de klasse na drie jaar in de MotoGP te hebben gereden. Hij bleek de te kloppen coureur te zijn en hij behaalde op een Ducati zijn tweede wereldkampioenschap. James Toseland eindigde als tweede, terwijl Noriyuki Haga derde werd. Regerend kampioen Troy Corser eindigde op de vierde plaats in het klassement.
| Team | Constructeur | Motor | Nr. | Coureur | Races | | Alstare Suzuki Corona Extra | Suzuki | Suzuki GSXR1000 K6 | 1 |  Troy Corser | Alle | | 71 |  Yukio Kagayama | Alle | | Yamaha Motor France-Ipone | Yamaha | Yamaha YZF-R1 | 3 | Norifumi Abe | Alle | | 16 |  Sébastien Gimbert | 1-2, 4-9, 11-12 | | 61 |  Lorenzo Alfonsi | 3 | | Klaffi Honda | Honda | Honda CBR1000RR | 4 |  Alex Barros | Alle | | D.F.X. Treme | Honda | Honda CBR1000RR | 7 | Pierfrancesco Chili | 1-2, 6-12 | | 69 | Gianluca Nannelli | 3-6 | | 84 | Michel Fabrizio | Alle | | Team Pedercini | Ducati | Ducati 999 RS | 8 | Ivan Clementi | Alle | | 19 | Lucio Pedercini | 1-5 | | 76 |  Max Neukirchner | 1-6 | | 80 |  Kurtis Roberts | 8-12 | | 91 |  Paweł Szkopek | 7 | | PSG-1 Kawasaki Corse | Kawasaki | Kawasaki ZX10R | 9 |  Chris Walker | Alle | | 55 | Régis Laconi | Alle | | PSG-1 Kawasaki Corse 2 | Kawasaki | Kawasaki ZX10R | 10 |  Fonsi Nieto | Alle | | Sterilgarda - Berik | Ducati | Ducati 999 F05 | 11 | Rubén Xaus | Alle | | 13 | Vittorio Iannuzzo | 12 | | 20 | Marco Borciani | 1-11 | | Emmebi Team | Honda | Honda CBR1000RR | 12 | Ivan Goi | 11-12 | | Celani Team Suzuki Italia | Suzuki | Suzuki GSXR1000 K6 | 13 | Vittorio Iannuzzo | 1-11 | | Alstare Eng. Corona Extra | Suzuki | Suzuki GSXR1000 K6 | 15 | Fabien Foret | 1-7 | | 76 | Max Neukirchner | 9-12 | | Foggy Petronas Racing | Petronas | Petronas FP1 | 18 | Craig Jones | Alle | | 99 | Steve Martin | Alle | | Ducati Xerox | Ducati | Ducati 999 F06 | 21 | Troy Bayliss | Alle | | 57 | Lorenzo Lanzi | Alle | | Prorace | Suzuki | Suzuki GSXR1000 K6 | 22 |  Miloš Čihák | 7 | | SBK Team JM | Ducati | Ducati 999 RS | 23 | Jiří Mrkývka | 7 | | Kawasaki Bertocchi | Kawasaki | Kawasaki ZX10R | 25 | Josh Brookes | 5-12 | | 116 | Franco Battaini | 1-4 | | Kawasaki Docshop Racing | Kawasaki | Kawasaki ZX10R | 26 | Stefan Nebel | 10 | | Coronas Suzuki Motorrad | Suzuki | Suzuki GSXR1000 K6 | 27 | Anthony Gobert | 3 | | 35 | Sergio Fuertes | 3 | | Spring Ducati | Ducati | Ducati 999 RS | 28 | Lorenzo Mauri | 4 | | Winston Ten Kate Honda | Honda | Honda CBR1000RR | 31 | Karl Muggeridge | 1-2, 4-12 | | 52 | James Toseland | Alle | | 200 | Giovanni Bussei | 3 | | Honda BQR | Honda | Honda CBR1000RR | 32 | Javier del Amor | 3 | | 33 | José David de Gea | 3 | | Yamaha Factory | Yamaha | Yamaha YZF-R1 | 34 | Josep Monge | 3 | Pro-SBK Racing
Yamaha Junior Pro-SBK Racing | Yamaha | Yamaha YZF-R1 | 36 | Jiří Dražďák | 7, 10, 12 | | Jafferson Racing | Yamaha | Yamaha YZF-R1 | 37 | Marek Svoboda | 7 | | Yamaha Motor France-Ipone 2 | Yamaha | Yamaha YZF-R1 | 38 | Shinichi Nakatomi | Alle | | Berten Racing | Yamaha | Yamaha YZF-R1 | 39 |  Berto Camlek | 7 | | Yamaha Motor Italia WSB | Yamaha | Yamaha YZF-R1 | 41 | Noriyuki Haga | Alle | | 88 | Andrew Pitt | Alle | | Ducati SC - Caracchi | Ducati | Ducati 999 F05 | 44 | Roberto Rolfo | Alle | | Team Guandalini | Ducati | Ducati 999 RS | 66 | Norino Brignola | 3-4, 6, 11 | | Virgin Mobile Yamaha | Yamaha | Yamaha YZF-R1 | 81 | Tommy Hill | 5, 8 | | MGM - TTSL Racing | Yamaha | Yamaha YZF-R1 | 83 |  Didier Van Keymeulen | 10 | | PN Corse | Ducati | Ducati 999 RS | 85 | Valter Bartolini | 11 | | 105 | Lorenzo Alfonsi | 4, 6 | | D'Antin MotoGP | Yamaha | Yamaha YZF-R1 | 95 |  Talal Al Naimi | 1 | | Motoport Den Bosch - Suzuki | Suzuki | Suzuki GSXR1000 K2 | 96 |  Harry van Beek | 9 | | |
| | | Kleur | Resultaat | | Goud | Winnaar | | Zilver | 2e plaats | | Brons | 3e plaats | | Groen | Gefinisht, in de punten | | Blauw | Gefinisht, geen punten | | Niet geclassificeerd (NC) | | Paars | Niet gefinisht (DNF) | | Rood | Niet gekwalificeerd (DNQ) | | Niet voorgekwalificeerd (DNPQ) | | Zwart | Gediskwalificeerd (DSQ) | | Wit | Niet gestart (DNS) | | Teruggetrokken (WD) | | Race geannuleerd (C) | | Leeg | Niet deelgenomen | | Uitgesloten (EX) | Vet – Pole position
Schuin – Snelste ronde |
| Pos | Constructeur | LOS
| PHI
| VAL
| MON
| SIL
 | MIS
 | BRN
| BRH
| ASS
| LAU
| IMO
| MAG
| Ptn |
| R1 | R2 | R1 | R2 | R1 | R2 | R1 | R2 | R1 | R2 | R1 | R2 | R1 | R2 | R1 | R2 | R1 | R2 | R1 | R2 | R1 | R2 | R1 | R2 |
| 1 | Ducati | 2 | 2 | 5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 7 | 12 | 8 | 1 | 2 | 7 | 1 | 7 | 3 | 5 | 1 | 4 | 1 | 450 |
| 2 | Honda | 1 | 4 | 2 | 2 | 9 | 10 | 2 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 3 | 7 | 5 | 1 | 1 | 2 | 1 | 3 | 414 |
| 3 | Yamaha | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 2 | 2 | 5 | 1 | 4 | 3 | 3 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 2 | 4 | 401 |
| 4 | Suzuki | 4 | 1 | 1 | 6 | 2 | 2 | 3 | 2 | 14 | 6 | 3 | 5 | 1 | 1 | 5 | 6 | 6 | 4 | 1 | 4 | DNF | 3 | 3 | 2 | 372 |
| 5 | Kawasaki | 13 | 12 | 8 | 9 | 8 | 6 | 7 | 8 | 6 | 8 | 6 | 4 | 6 | 6 | 7 | 4 | 1 | 3 | 10 | 7 | 7 | 10 | 6 | 8 | 229 |
| 6 |  Petronas | 18 | 18 | 14 | 15 | 22 | 15 | DNF | DNF | DNF | DNF | 21 | 17 | 17 | 19 | 17 | 16 | 12 | 11 | 14 | 12 | 17 | 16 | 17 | DNF | 19 |
| Pos | Constructeur | LOS
| PHI
| VAL
| MON
| SIL
| MIS
| BRN
| BRH
| ASS
| LAU
| IMO
| MAG
| Ptn |
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
Honda 
Petronas 
· 
· 