덴드로그램
덴드로그램(Dendrogram)은 나무를 나타내는 다이어그램이다. 이 도식적 표현은 다양한 상황에서 자주 사용된다.
- 계층적 군집화에서는 해당 분석에 의해 생성된 클러스터의 배열을 보여준다.[2]
- 계산생물학에서는 때로는 히트맵의 가장자리에 유전자나 샘플의 클러스터링을 보여준다.[3]
- 계통학에서는 다양한 생물학적 분류군 간의 진화적 관계를 보여준다. 이 경우 덴드로그램을 계통수라고도 한다.[4]
'덴드로그램'이라는 이름은 "나무"를 의미하는 두 개의 고대 그리스 단어 δένδρον(déndron)와 "그림, 수학적 수치"를 의미하는 γράμμα(grámma)에서 유래되었다.[5][6]
같이 보기
[편집]각주
[편집]- ↑ Swofford, David L.; Olsen, Gary J.; Waddell, Peter J.; Hillis, David M. (1996). 〈Phylogenetic inference〉. Hillis, David M.; Moritz, Craig; Mable, Barbara K. 《Molecular Systematics, 2nd edition》. Sunderland, MA: Sinauer. 407–514쪽. ISBN 9780878932825.
- ↑ Everitt, Brian (1998). 《Dictionary of Statistics》. Cambridge, UK: Cambridge University Press. 96쪽. ISBN 0-521-59346-8.
- ↑ Wilkinson, Leland; Friendly, Michael (May 2009). “The History of the Cluster Heat Map”. 《The American Statistician》 63 (2): 179–184. CiteSeerX 10.1.1.165.7924. doi:10.1198/tas.2009.0033. S2CID 122792460.
- ↑ 〈Phylogenetic tree (biology)〉. 《Encyclopedia Britannica》 (영어). 2018년 10월 22일에 확인함.
- ↑ Bailly, Anatole (1981년 1월 1일). 《Abrégé du dictionnaire grec français》. Paris: Hachette. ISBN 2010035283. OCLC 461974285.
- ↑ Bailly, Anatole. “Greek-french dictionary online”. 《www.tabularium.be》. 2018년 10월 20일에 확인함.
출처
[편집]- Galili, T. (2015). “dendextend: an R package for visualizing, adjusting and comparing trees of hierarchical clustering”. 《Bioinformatics》 31 (22): 3718–3720. doi:10.1093/bioinformatics/btv428. PMC 4817050. PMID 26209431.
외부 링크
[편집]- Iris dendrogram - Example of using a dendrogram to visualize the 3 clusters from hierarchical clustering using the "complete" method vs the real species category (using R).