Escherichia coli O104: H4
L'Escerichia coli O104: H4 è un ceppo enteroaggregativo del batterio Escherichia coli, esso è stato causa dell'epidemia di Escherichia coli O104: H4 del 2011.[1] La "O" nella classificazione sierologica identifica l'antigene lipopolisaccaride della parete cellulare e la "H" identifica l'antigene flagello.
L'analisi delle sequenze genomiche ottenute da BGI Shenzhen mostra che il ceppo epidemico O104: H4 è un tipo enteroaggregativo di E. coli (EAEC o EAggEC) che ha acquisito i geni della tossina Shiga, presumibilmente mediante trasferimento genico orizzontale.[2][3][4] L'assemblaggio genomico ha confermato che due copie della tossina Shiga stx2 profago gene cluster sono una caratteristica distintiva del genoma del ceppo epidemico O104: H4.[5][6]
Il ceppo O104: H4 è caratterizzato da questi marcatori genetici:[7]
- Tossina Shiga stx2 positiva
- gene di resistenza alla tellurite cluster positivo
- gene dell'aderenza all'intimina negativo
- Sono presenti β-lattamasi ampC, ampD, ampE, ampG, ampH.
L'approccio integrato alla sicurezza alimentare della Commissione europea (CE)[8] definisce un caso di diarrea da E. coli produttore di tossina simile a Shiga (STEC) causata da O104: H4 da un'insorgenza acuta di diarrea o diarrea sanguinolenta insieme alla rilevazione di la tossina Shiga 2 (Stx2) o il gene Shiga stx2.[9] Prima dell'epidemia del 2011, era stato osservato un solo caso identificato come O104: H4, in una donna in Corea del Sud nel 2005.[10]
L'E. coli O104: H4 è difficile da trattare in quanto è resistente a molti antibiotici, sebbene sia sensibile ai carbapenemi.[11]
Note[modifica | modifica wikitesto]
- ^ Alexander Mellman, D Harmsen e CA Cummings, Prospective genomic characterization of the German enterohemorrhagic Escherichia coli O104:H4 outbreak by rapid next generation sequencing technology, in PLoS One, vol. 6, n. 7, July 20, 2011, pp. e22751, DOI:10.1371/journal.pone.0022751, PMID 21799941.
- ^ genomics.cn, http://www.genomics.cn/en/news_show.php?type=show&id=644. URL consultato il 2 giugno 2011.
- ^ David Tribe, Copia archiviata, su biofortified.org. URL consultato il 2 giugno 2011 (archiviato dall'url originale il 27 maggio 2012).
- ^ Maev Kennedy and agencies, E. coli outbreak: WHO says bacterium is a new strain, London, guardian.co.uk, 2 giugno 2011. URL consultato il 4 giugno 2011.
- ^ genomics.cn, http://www.genomics.cn/en/news_show.php?type=show&id=660. URL consultato il 20 giugno 2011.
- ^ bioinf.jku.at, http://www.bioinf.jku.at/research/ehec/ehec.html. URL consultato il 15 giugno 2011.
- ^ Copia archiviata (PDF), su rki.de. URL consultato il 15 giugno 2011 (archiviato dall'url originale il 25 marzo 2012).
- ^ ec.europa.eu, http://ec.europa.eu/food/intro_en.htm.
- ^ ec.europa.eu, http://ec.europa.eu/food/food/docs/STEC-HUS_CaseDefinition_03062011_en.pdf. URL consultato il 16 giugno 2011.
- ^ WK Bae, YK Lee e MS Cho, A case of haemolytic uremic syndrome caused by Escherichia coli O104:H4, in Yonsei Medical Journal, vol. 47, n. 3, June 30, 2006, pp. 473–479, DOI:10.3349/ymj.2006.47.3.437, PMID 16807997.
- ^ Gorman, Christine. "E. Coli on the March: Scientific American." Science News, Articles and Information | Scientific American. Scientific American, 7 Aug. 2011. Web. 08 Nov. 2011.<http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=e-coli-on-the-march>.